不远的未来,一场几乎毁灭世界的大战使人类丧失航海的能力。在持续开发舰娘技术的过程中,部分舰娘成功觉醒自主意识并且发生了形态上的异变。面对这些不再服从的舰娘,四大财团纠结军力,成立联合组织,旨在彻底消灭所有不受控制的觉醒舰娘。玩家将作为指挥官,与少女们共同谱写宿命与叛逆的物语